本系設立於1994年，前身為國立高雄海專澎湖分部電訊工程科，招收日間部二專，1995年7月1日獨立設校為國立澎湖海事管理專科學校電訊工程科。2000年經學校准改制為國立澎湖技術學院，2002年教育部評鑑教學研究績效一等，改制為電信工程系，招收四技日間部，目前每一年級招生一班。

　　本系師資優良，設備齊全，教育理念為『理論與實務並重，人文與科技均衡』，授課內容涵蓋電子電機相關領域，包含通訊與信號處理、射頻及微波二大方向，並與電腦及網路技術互相結合，發展無線通訊與人工智慧(AI)之應用, 著重學生實務能力，鼓勵考取專業證照。專業實驗室每星期晚間固定開放供同學自由使用，使學生在紮實及多樣的學習下，不論繼續升學或就業均能有良好的發展。

　　本系結合院內電資科系成立研究所，並於97學年度正式招生，長期目標則以現有二大專業課程領域為發展重點，期望成為人才養成與技術提供之中心。

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